233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0872 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  63.36 
 
 		 295 aa  349  3e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  61.89 
 
 		 295 aa  342  5e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  40.15 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  43.14 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  43.53 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  41.96 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  39 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  40.54 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  39 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  37.45 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  37.45 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  40.15 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  37.45 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  37.45 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  37.45 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  41.57 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  37.45 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  42.35 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  40.78 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  41.09 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  42.35 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  38.22 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  42.35 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  37.07 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  40.68 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  37.89 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  36.6 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  38.13 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  37.16 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  37.22 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  36.23 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  34.96 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  35.55 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  35.55 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  33.83 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  36.36 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  36.36 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  39.74 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  36.15 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  29.89 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  34.76 
 
 		 199 aa  106  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  26.1 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  27.57 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  29.17 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.28 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.28 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.45 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0179  hypothetical protein  24.89 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  32.54 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.84 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.42 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.7 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  25 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.87 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.52 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  53.06 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  28.28 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 		 232 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.37 
 
 		 232 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  27.92 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.03 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.82 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.03 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>