76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4421 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  83.51 
 
 		 291 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  72.66 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  61.89 
 
 		 303 aa  352  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  60.22 
 
 		 295 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  59.85 
 
 		 295 aa  341  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  58.27 
 
 		 317 aa  341  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  57.52 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  54.68 
 
 		 295 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  54.68 
 
 		 295 aa  331  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  54.68 
 
 		 295 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  60.08 
 
 		 291 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  59.04 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  56.41 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  55.87 
 
 		 395 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  55.87 
 
 		 404 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  55.87 
 
 		 404 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  55.87 
 
 		 404 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  55.87 
 
 		 486 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  56.41 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  52.33 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  51.94 
 
 		 293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  55.31 
 
 		 444 aa  315  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  55.22 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  52.92 
 
 		 293 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  53.26 
 
 		 293 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.84 
 
 		 296 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  50.17 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  52.79 
 
 		 293 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  45.74 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  47.74 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 299 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  44.64 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 		 307 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  43.28 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  43.28 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  43.28 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  42.91 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  42.11 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  47.74 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  42.47 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  38.54 
 
 		 304 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  39.85 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  31.32 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  30.19 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  27.56 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  25.33 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.7 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  24.33 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  22.93 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.74 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 317 aa  49.3  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.85 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  18.7 
 
 		 444 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>