More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2899 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  63.83 
 
 
673 aa  885    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  65.81 
 
 
663 aa  874    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  66.62 
 
 
673 aa  897    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.63 
 
 
670 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  52 
 
 
680 aa  683    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
680 aa  1390    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  64.22 
 
 
684 aa  887    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.38 
 
 
657 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
657 aa  343  9e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 
654 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.34 
 
 
660 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
662 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.33 
 
 
657 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 
689 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 
657 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  32.81 
 
 
713 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.58 
 
 
656 aa  301  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  33.54 
 
 
695 aa  301  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
723 aa  299  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
672 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.88 
 
 
711 aa  296  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.6 
 
 
708 aa  289  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  34.04 
 
 
740 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 
586 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  33.18 
 
 
646 aa  283  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  31.01 
 
 
721 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  33.14 
 
 
644 aa  280  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  30.72 
 
 
728 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
705 aa  274  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
690 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
729 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 
671 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
631 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  29.79 
 
 
734 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.52 
 
 
682 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.61 
 
 
703 aa  259  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 
582 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
675 aa  257  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
670 aa  257  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 
553 aa  256  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  30 
 
 
727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 
675 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 
645 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
675 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
675 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 
644 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
588 aa  253  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  33.85 
 
 
638 aa  253  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
578 aa  252  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
570 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  30.22 
 
 
719 aa  251  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  29.59 
 
 
727 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 
654 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  32.43 
 
 
583 aa  250  6e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  31.32 
 
 
662 aa  249  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
649 aa  249  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.67 
 
 
622 aa  249  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
578 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
578 aa  246  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  31.64 
 
 
638 aa  246  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 
614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  31.49 
 
 
638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  31.49 
 
 
638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  31.34 
 
 
638 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  31.15 
 
 
638 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.36 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  31.21 
 
 
638 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.42 
 
 
704 aa  243  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  30.13 
 
 
645 aa  243  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  31.36 
 
 
638 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 
649 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  31.36 
 
 
638 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  31.21 
 
 
638 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  31.07 
 
 
638 aa  242  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  31.49 
 
 
638 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  30.24 
 
 
669 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 
578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  32.17 
 
 
631 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 
736 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 
618 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
630 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  31.82 
 
 
577 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
577 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
630 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  30.81 
 
 
708 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
632 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
632 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 
656 aa  238  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
632 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6973  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
701 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.846927  normal  0.0145645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
614 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  32.15 
 
 
653 aa  237  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
708 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  32.29 
 
 
614 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>