More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2863 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 151 aa  316  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  83.69 
 
 		 144 aa  256  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  65.47 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  62.68 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  58.04 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  51.45 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.77 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  50.72 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.74 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  46.48 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  48.18 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  48.91 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.48 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  51.82 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  47.45 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  46.53 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.18 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.66 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.15 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  43.8 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  42.45 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  43.61 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.34 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  45.38 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 258 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.8 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.8 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  43.07 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  41.96 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  39.44 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  42.42 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.03 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  38.97 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 255 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  42.54 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.84 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  45.31 
 
 		 258 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  43.28 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  40.29 
 
 		 254 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  42.55 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  41.46 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.23 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 175 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.72 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.28 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  38.85 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.86 
 
 		 453 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  38.36 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  41.22 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  38.13 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  38.13 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  38.85 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 269 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  37.68 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.54 
 
 		 287 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  39.85 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  38.85 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  38.85 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  38.85 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.06 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  32.19 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  40.85 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  41.22 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  42.19 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.54 
 
 		 299 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.29 
 
 		 270 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 275 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.71 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  42.54 
 
 		 299 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  36.23 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  36.11 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 254 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 		 179 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.37 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.22 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 276 aa  90.9  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  39.44 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  35 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  39.01 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  35 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>