209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1266 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  100 
 
 		 447 aa  927    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  66.52 
 
 		 444 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  46.12 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  48.33 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  47.4 
 
 		 447 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  47.55 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  44.5 
 
 		 426 aa  359  7e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.82 
 
 		 447 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  43.9 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  40.72 
 
 		 490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  42.33 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  44.96 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  42.49 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  42.62 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  40.71 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  39.08 
 
 		 456 aa  279  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  37.34 
 
 		 451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  38.92 
 
 		 419 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  36.26 
 
 		 420 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  35.2 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  35.32 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  34.62 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  34.49 
 
 		 412 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  34.43 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.92 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  33.41 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  33.1 
 
 		 419 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  33.1 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.81 
 
 		 416 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.64 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  31.88 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.95 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  31.11 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  30.88 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  30.79 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  30.88 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  31.03 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  32.95 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.56 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.17 
 
 		 414 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.24 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  31.38 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.42 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  32.88 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  32.71 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33.57 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  33.24 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  31.52 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.03 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  30.93 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  32.37 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.35 
 
 		 430 aa  163  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 445 aa  162  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  29.16 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  30.98 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  29.7 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.64 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  28.31 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.23 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  28.57 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  30.46 
 
 		 403 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.81 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  29.84 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.18 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.18 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.18 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.97 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  28.84 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.64 
 
 		 413 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.65 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.18 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.3 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.35 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.74 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.01 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  28.23 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.61 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  28.13 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  28.95 
 
 		 407 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  29.24 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  30.18 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.08 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  29.4 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  31.02 
 
 		 440 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  26.91 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.77 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.5 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.65 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.51 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.74 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.87 
 
 		 400 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.1 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.74 
 
 		 409 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.74 
 
 		 409 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.27 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.27 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  27.7 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.12 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.69 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>