More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0671 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  58.93 
 
 
886 aa  841  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  100 
 
 
730 aa  1491  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  56.18 
 
 
746 aa  781  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  51.65 
 
 
748 aa  708  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  48.77 
 
 
727 aa  675  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  48.9 
 
 
723 aa  674  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  61 
 
 
878 aa  862  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  53.66 
 
 
751 aa  751  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  52.9 
 
 
741 aa  740  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  54.05 
 
 
755 aa  739  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  52.26 
 
 
727 aa  765  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.02251e-09 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  53.54 
 
 
722 aa  729  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  59.2 
 
 
883 aa  828  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  49.72 
 
 
871 aa  671  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  50.49 
 
 
723 aa  697  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  51.18 
 
 
730 aa  708  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  53.44 
 
 
744 aa  741  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  58.93 
 
 
886 aa  841  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  52.99 
 
 
743 aa  767  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  40.8 
 
 
856 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  39.33 
 
 
896 aa  495  1e-138  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  40.22 
 
 
856 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  39.46 
 
 
875 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  40.14 
 
 
865 aa  470  1e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.42292e-09 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  39.4 
 
 
858 aa  468  1e-130  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  40.53 
 
 
856 aa  465  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  39.43 
 
 
861 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  39.56 
 
 
861 aa  465  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  37.12 
 
 
876 aa  459  1e-128  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  37.64 
 
 
857 aa  460  1e-128  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  39.18 
 
 
879 aa  461  1e-128  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  40.6 
 
 
856 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  38.81 
 
 
910 aa  454  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  37.43 
 
 
894 aa  452  1e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37.48 
 
 
894 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  38.04 
 
 
879 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  37.07 
 
 
895 aa  447  1e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  39.43 
 
 
914 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  39.37 
 
 
861 aa  441  1e-122  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  37.02 
 
 
877 aa  439  1e-122  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  40.3 
 
 
855 aa  442  1e-122  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  40.3 
 
 
855 aa  442  1e-122  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  37.16 
 
 
877 aa  440  1e-122  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  39.56 
 
 
890 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  36.91 
 
 
908 aa  439  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  38.95 
 
 
855 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  35.14 
 
 
902 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  37.77 
 
 
885 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  37.56 
 
 
918 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  36.95 
 
 
862 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  35.03 
 
 
887 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  34.24 
 
 
882 aa  426  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  36.87 
 
 
901 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  38.47 
 
 
855 aa  416  1e-115  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  34.95 
 
 
939 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.89 
 
 
900 aa  412  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  35.84 
 
 
906 aa  406  1e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  38.83 
 
 
872 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  34.33 
 
 
893 aa  399  1e-110  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  35.87 
 
 
881 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  30.99 
 
 
874 aa  344  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  31.13 
 
 
874 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  32.45 
 
 
622 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  29.67 
 
 
637 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  31.66 
 
 
636 aa  176  1e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  31.62 
 
 
664 aa  176  2e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.78 
 
 
647 aa  171  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.97 
 
 
573 aa  164  5e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  27.95 
 
 
646 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.86 
 
 
778 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.86 
 
 
778 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  32.5 
 
 
328 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
593 aa  138  3e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.07 
 
 
757 aa  138  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  31.33 
 
 
585 aa  137  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.81 
 
 
755 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 
1103 aa  135  4e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
588 aa  134  4e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  30.87 
 
 
581 aa  132  2e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  25.94 
 
 
1086 aa  132  2e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.1 
 
 
755 aa  132  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.69 
 
 
569 aa  131  4e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
593 aa  131  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  28.86 
 
 
582 aa  129  1e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  30.61 
 
 
581 aa  130  1e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  31.69 
 
 
571 aa  129  1e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
582 aa  129  1e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  30.36 
 
 
581 aa  129  2e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  30.36 
 
 
581 aa  129  2e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.79 
 
 
578 aa  129  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  28.93 
 
 
597 aa  128  4e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  29.52 
 
 
579 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
588 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  29.52 
 
 
579 aa  126  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  30.13 
 
 
585 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  27.33 
 
 
441 aa  124  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  29.91 
 
 
584 aa  122  2e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  29.77 
 
 
612 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
581 aa  118  4e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
562 aa  118  4e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>