More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0832 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 346 aa  703    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  55.52 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  55.82 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  49.85 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  42.69 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.76 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.73 
 
 		 340 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.73 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.03 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.03 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 342 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  35.69 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.63 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.33 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  33.33 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  33.33 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  33.33 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  34.51 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  35.48 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.63 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.99 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.67 
 
 		 347 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  37.42 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.24 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  31.95 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  36.18 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.22 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.85 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  35.88 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.23 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.44 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 344 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.44 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.35 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 391 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  38.39 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  32.75 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.4 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.18 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.34 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.12 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.04 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.43 
 
 		 333 aa  189  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  34.58 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.17 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.61 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  32.46 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  33.86 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.31 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>