51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2315 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  62.09 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  61.61 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  37 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  38.33 
 
 		 478 aa  121  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  33.18 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  31.34 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  37.55 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.89 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  32.52 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  31.67 
 
 		 483 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.36 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  35.24 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  33.81 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  32.2 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  34.01 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  27.75 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  29.17 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.71 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  34.07 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  35.78 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.53 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  38.73 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  39.36 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  38.3 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  27.46 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  28.7 
 
 		 330 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  28.04 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  28.7 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  29.63 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  31.52 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>