33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0214 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  46.85 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  45.22 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  39.29 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  40.14 
 
 		 301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  40.14 
 
 		 301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  44.34 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  52.55 
 
 		 327 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  52.55 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  52.55 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.99 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  51.82 
 
 		 179 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  51.82 
 
 		 174 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  30.14 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  30.34 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  34.75 
 
 		 208 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  33.81 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  33.57 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  31.34 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  36.26 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  24.5 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  33.09 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  30 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  29.36 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1597  hypothetical protein  60 
 
 		 78 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  37.08 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  37.21 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  32.56 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.46 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  25.58 
 
 		 337 aa  48.5  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  34.44 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  28.42 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>