36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1780 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  91.93 
 
 
327 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  89.33 
 
 
328 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  96.35 
 
 
301 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  80.07 
 
 
288 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  79.35 
 
 
231 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  42.29 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1597  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  51.82 
 
 
241 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.21 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  37.32 
 
 
240 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  33.11 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  32.79 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.18 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  34.88 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  33.08 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  34.07 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  34.57 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  31.34 
 
 
226 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.82 
 
 
224 aa  59.3  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  34.41 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  28.43 
 
 
483 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.76 
 
 
222 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  30.21 
 
 
231 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  33.71 
 
 
212 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  27.07 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  28.42 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6680  putative cytoplasmic protein  32.65 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  36.47 
 
 
233 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  31.91 
 
 
328 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>