41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2838 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  91.93 
 
 		 301 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  91.93 
 
 		 301 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  95.73 
 
 		 328 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  93.42 
 
 		 301 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  74.84 
 
 		 288 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  98.82 
 
 		 179 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  98.78 
 
 		 174 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  78.75 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1597  hypothetical protein  98.72 
 
 		 78 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  52.55 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  45.36 
 
 		 232 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.13 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  38.03 
 
 		 240 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  33.11 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  32.02 
 
 		 234 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.18 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  34.88 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  35.8 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  33.1 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  33.09 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  40 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  34.41 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  28.04 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.76 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  30.21 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  34.74 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  34.86 
 
 		 2851 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  27.07 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  43.04 
 
 		 717 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  27.37 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  48.98 
 
 		 688 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6680  putative cytoplasmic protein  32.65 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  63.33 
 
 		 709 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  36.47 
 
 		 233 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  34.12 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  62.07 
 
 		 675 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  31.91 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>