30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00249 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  33.47 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  46.24 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  44.68 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  44.44 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  40.91 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  37.63 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  39.39 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  42.57 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  32.63 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  34.67 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  35.11 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  36 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  36 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  36 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  38.46 
 
 		 483 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  36 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  36 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  36 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  36 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  36.73 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  36 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.2 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  31.82 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  37.21 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  36.36 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  41.3 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  38.64 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  38.55 
 
 		 171 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>