36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1203 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  97.67 
 
 
301 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  97.67 
 
 
301 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  93.1 
 
 
327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  91.16 
 
 
328 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  79.61 
 
 
288 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  99.38 
 
 
179 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  99.38 
 
 
174 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  82.19 
 
 
231 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  41.84 
 
 
232 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1597  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  52.55 
 
 
241 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.23 
 
 
235 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  38.03 
 
 
240 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  34.07 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  32.79 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.18 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  34.88 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  33.08 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  34.57 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  30.6 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.82 
 
 
224 aa  59.3  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  34.41 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  28.43 
 
 
483 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  30.21 
 
 
231 aa  55.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.76 
 
 
222 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  33.71 
 
 
212 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  27.07 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  28.42 
 
 
327 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6680  putative cytoplasmic protein  32.65 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  36.47 
 
 
233 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  31.91 
 
 
328 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>