40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01946 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  61.28 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  61.28 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  61.28 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  61.28 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  61.28 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  61.28 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  61.28 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  61.4 
 
 		 330 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  59.15 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  58.84 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  58.84 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  58.84 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  59.15 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  58.84 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  58.54 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  42.02 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  41.34 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  24.84 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  23.2 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  23.81 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  24.53 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  21.15 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  29.9 
 
 		 483 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  28.04 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  32.22 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  28.71 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  30.68 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  34.41 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  28.91 
 
 		 179 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  28.91 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  28.91 
 
 		 174 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  31.91 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  28.91 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  31.91 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  31.91 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  31.91 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  34.78 
 
 		 208 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  34.41 
 
 		 226 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>