27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3574 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  97.57 
 
 
329 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  96.05 
 
 
329 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  97.57 
 
 
329 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  97.87 
 
 
329 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  97.57 
 
 
329 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  97.57 
 
 
329 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  86.32 
 
 
329 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  87.27 
 
 
330 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  58.54 
 
 
328 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  41.95 
 
 
327 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  39.39 
 
 
327 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  36.9 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  25.97 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  24.66 
 
 
302 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  32.32 
 
 
483 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  23.97 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  29.63 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  27.91 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>