38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2187 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  41.21 
 
 
329 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  41.21 
 
 
329 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  41.21 
 
 
329 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  41.21 
 
 
329 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  41.21 
 
 
329 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  41.21 
 
 
329 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  40.91 
 
 
329 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  39.88 
 
 
330 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  40.61 
 
 
329 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  40.61 
 
 
329 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  40.61 
 
 
329 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  41.34 
 
 
328 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  40.3 
 
 
329 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  39.39 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  39.09 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  39.09 
 
 
329 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  35.45 
 
 
327 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  28.76 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  24.45 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  26.79 
 
 
302 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  23.97 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  37.8 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  31.52 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  31.52 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  32.26 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  28.07 
 
 
171 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  30.84 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  28 
 
 
483 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31 
 
 
208 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  26.51 
 
 
224 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>