28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4922 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  100 
 
 		 330 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  89.09 
 
 		 329 aa  603  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  88.79 
 
 		 329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  88.79 
 
 		 329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  88.79 
 
 		 329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  88.79 
 
 		 329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  88.79 
 
 		 329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  88.79 
 
 		 329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  88.75 
 
 		 329 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  88.75 
 
 		 329 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  88.75 
 
 		 329 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  88.15 
 
 		 329 aa  591  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  87.27 
 
 		 329 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  87.54 
 
 		 329 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  87.23 
 
 		 329 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  61.4 
 
 		 328 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  42.42 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  39.88 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  24.4 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  23.79 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  33.7 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  33.33 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  28.33 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  29.17 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  22.36 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  28.7 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  26.97 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  30.34 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>