30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2261 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  44.7 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  48.19 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  46.21 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  42.72 
 
 
302 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  28.95 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  28.51 
 
 
329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  28.51 
 
 
329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  28.51 
 
 
329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  28.51 
 
 
329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  28.51 
 
 
329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  28.51 
 
 
329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  36.9 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  29.11 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  36.9 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  36.9 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  36.9 
 
 
329 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  36.9 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  26.46 
 
 
329 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  33.7 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  31.58 
 
 
328 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  37.8 
 
 
327 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  33.05 
 
 
234 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  31.19 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  29.55 
 
 
237 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  25 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  31.76 
 
 
176 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  28.89 
 
 
222 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  30.68 
 
 
243 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>