26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4963 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  59.22 
 
 		 302 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  60.06 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  58.25 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  44.7 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  28.76 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  26.92 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  23.79 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  23.81 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  26.52 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  25.97 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  26.09 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  28.46 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  24.56 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  24.56 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  24.56 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  24.56 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  24.56 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  24.56 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  24.56 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.25 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  26.62 
 
 		 224 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>