36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0517 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  100 
 
 		 208 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  38.89 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  49.02 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  38.85 
 
 		 258 aa  88.2  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  48.42 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  34.75 
 
 		 241 aa  85.1  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  49.44 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  35.85 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  46.59 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  36.55 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  32.45 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  38.54 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  46.15 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  42.42 
 
 		 478 aa  78.2  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  25.69 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  49.43 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  32.09 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  36.89 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  42.35 
 
 		 179 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  42.35 
 
 		 288 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  39.58 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  36.89 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  39.58 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  39.58 
 
 		 301 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  36.89 
 
 		 328 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  27.93 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.46 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  38.68 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  37.23 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  34.48 
 
 		 337 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  32.56 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.48 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  31 
 
 		 327 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  34.78 
 
 		 328 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>