89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1383 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  39.74 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  33.5 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  36.46 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  41.3 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  39.51 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  40.77 
 
 		 210 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  31.22 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  29.88 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  37.18 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  34.25 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  30.89 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  39.46 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  33.33 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  34.06 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  34.94 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  33.33 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  30.52 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  29.75 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  34.19 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  34.19 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  29.19 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  28.99 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  37.84 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  42.53 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  28.48 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  28.48 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  28.48 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  28.48 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  27.74 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  30.6 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  27.03 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45902  predicted protein  27.45 
 
 		 410 aa  49.3  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.361272 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  29.57 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  28.57 
 
 		 338 aa  49.3  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  34.33 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  34.33 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  31.71 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  29.46 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.52 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  33.93 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.52 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  31.3 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  28.47 
 
 		 566 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  33.61 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.61 
 
 		 304 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92228  predicted protein  31.16 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  24.05 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  33.61 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48241  predicted protein  28.78 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.360676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  30.69 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.78 
 
 		 707 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26025  predicted protein  36.36 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.904011 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  31.15 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  26.73 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  47.83 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  36.62 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  31.3 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 		 301 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  28.46 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.78 
 
 		 707 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  29.1 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.27 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  28.57 
 
 		 288 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  27.64 
 
 		 356 aa  42  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.46 
 
 		 290 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147825 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04541  nicotinamide N-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17750)  28.39 
 
 		 350 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.969056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.53 
 
 		 233 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 309 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  27.54 
 
 		 219 aa  42  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  28.05 
 
 		 235 aa  42  0.01  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>