37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48241 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48241  predicted protein  100 
 
 
309 aa  634    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.360676  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41150  predicted protein  31.03 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36186  predicted protein  34.27 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  29.2 
 
 
210 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54329  Putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase of the seven beta-strand family  30.72 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.103283  hitchhiker  0.00259781 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93639  predicted protein  26.94 
 
 
281 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.252566 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29666  predicted protein  26.94 
 
 
281 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.294797  normal  0.0130447 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26025  predicted protein  32.03 
 
 
248 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.904011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4387  hypothetical protein  30.08 
 
 
247 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal  0.249207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  27.61 
 
 
244 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  27.35 
 
 
338 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  28.76 
 
 
566 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
198 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
198 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  26.55 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
250 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  26.03 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  24.11 
 
 
232 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  23.33 
 
 
237 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35519  predicted protein  29.81 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04470  hypothetical protein  29.63 
 
 
349 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0131065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  29.03 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32772  predicted protein  21.55 
 
 
371 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  31.2 
 
 
192 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.56 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.56 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.47 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  33.77 
 
 
196 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  29.66 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  51.02 
 
 
217 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  28.14 
 
 
1048 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  24.68 
 
 
248 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  26.13 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.56 
 
 
300 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>