More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1116 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  55.8 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  58.26 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  50 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  45.95 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  44.95 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  43.17 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  43.04 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  45.07 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  45.33 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  43.12 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  39.46 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  38.84 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  38.22 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  38.84 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  39.29 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  41.36 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  42.67 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.27 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.12 
 
 		 255 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0312  ABC transporter related  40.85 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.403569  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4557  ABC transporter related  39.73 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0557853 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4424  ABC transporter related  39.73 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.056527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.28 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  41.94 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  43.89 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  42.34 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.24 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  42.66 
 
 		 654 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.06 
 
 		 646 aa  181  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  43.58 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.28 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  42.53 
 
 		 242 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  44.09 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  44.5 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4546  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0534927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.76 
 
 		 648 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  42.59 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  45.54 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  40.97 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  40.2 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  40.2 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.92 
 
 		 648 aa  174  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 648 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4104  ABC transporter related  39.38 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0242374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  40.18 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.89 
 
 		 648 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  40.52 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  41.89 
 
 		 648 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  41.89 
 
 		 648 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.89 
 
 		 648 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  38.99 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.89 
 
 		 648 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  42.65 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  39.32 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  36.68 
 
 		 604 aa  172  5e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  43.72 
 
 		 221 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  41.67 
 
 		 648 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  41.67 
 
 		 648 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  38.53 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.78 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.13 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.2 
 
 		 648 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  38.81 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  39.91 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.2 
 
 		 648 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.2 
 
 		 648 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  37.72 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  37.5 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  40.36 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  37.55 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.2 
 
 		 648 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.63 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.2 
 
 		 648 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  39.66 
 
 		 653 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 		 345 aa  169  4e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  37 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  39.91 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.59 
 
 		 647 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>