More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0494 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0494  ribosomal protein S5  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.645622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  59.06 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  57.53 
 
 		 166 aa  176  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  53.5 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  58.9 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  57.43 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  57.43 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  52.87 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 		 169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  56.16 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 163 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  55.26 
 
 		 169 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  55.26 
 
 		 169 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  53.25 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  56.16 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  56.76 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  54.61 
 
 		 163 aa  167  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 163 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  54.73 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  53.55 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  55.48 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 210 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  52.63 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  56.94 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  51.95 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  55.03 
 
 		 197 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  57.05 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  56.94 
 
 		 166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  55.1 
 
 		 180 aa  163  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  56.94 
 
 		 166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  53.1 
 
 		 166 aa  163  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  54.42 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  51.97 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  52.23 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  52.41 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  55.7 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  54.11 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  50.62 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  56.16 
 
 		 166 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  51.97 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 223 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  52.41 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 223 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 223 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 200 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  53.1 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  50 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 215 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  52.74 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  53.1 
 
 		 172 aa  158  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 220 aa  158  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 222 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  52.67 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 190 aa  158  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  54.37 
 
 		 199 aa  158  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 225 aa  158  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  53.42 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 183 aa  157  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  51.03 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  52.74 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  52.53 
 
 		 208 aa  157  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  51.72 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  52.41 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 238 aa  157  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  50.96 
 
 		 202 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3280  30S ribosomal protein S5  49.35 
 
 		 172 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00328937  hitchhiker  0.0000684502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2933  30S ribosomal protein S5  49.35 
 
 		 172 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000097006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  50.97 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  52.7 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  50.34 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  50.68 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  52.05 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  52.05 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  51.01 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  50.68 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  50.68 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 236 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  52.05 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  52.9 
 
 		 205 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  47.1 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  52.05 
 
 		 167 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 189 aa  154  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>