26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0038 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
325 aa  676    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  46.98 
 
 
345 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  39.05 
 
 
540 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  37.68 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  36.73 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  40.1 
 
 
255 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  34.86 
 
 
247 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  40 
 
 
257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  35.68 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  35.21 
 
 
268 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  35.58 
 
 
259 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  31.62 
 
 
786 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  33.84 
 
 
258 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  32.32 
 
 
254 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  34.78 
 
 
281 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  30.3 
 
 
263 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  28.95 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  29.77 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  36.69 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  33.58 
 
 
629 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  35.07 
 
 
595 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  29.73 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  35.66 
 
 
478 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  31.54 
 
 
321 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  29.93 
 
 
628 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  29.29 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>