More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3259 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 414 aa  856    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.04 
 
 		 413 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 		 414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.43 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.2 
 
 		 414 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  62.71 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.49 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.44 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  63.9 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.03 
 
 		 418 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.7 
 
 		 413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.27 
 
 		 418 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.59 
 
 		 414 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.93 
 
 		 415 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  64.85 
 
 		 414 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  64.02 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.42 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.44 
 
 		 415 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  64.36 
 
 		 414 aa  554  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.17 
 
 		 419 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.77 
 
 		 420 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.71 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.52 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  62.59 
 
 		 413 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.78 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  62.01 
 
 		 416 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  59.26 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.57 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.01 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  58.02 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  56.82 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.52 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  53.58 
 
 		 414 aa  487  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.3 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  57.53 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  54.35 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.58 
 
 		 421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  53.47 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.25 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.57 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  53.13 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  53.13 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.09 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.95 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.36 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.52 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  52.49 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.74 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.48 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.5 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.16 
 
 		 404 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.4 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.86 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  52.78 
 
 		 626 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.1 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.78 
 
 		 629 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.09 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.87 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.26 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.23 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  52.74 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  52.74 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  50.99 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.01 
 
 		 657 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.76 
 
 		 774 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.59 
 
 		 664 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.21 
 
 		 427 aa  438  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.09 
 
 		 673 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.86 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 		 444 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.94 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  50.73 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.52 
 
 		 678 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.76 
 
 		 662 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  49.51 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  51.77 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  50.25 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.2 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  49.75 
 
 		 665 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  50.25 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  52.04 
 
 		 661 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  50 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  50 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.36 
 
 		 605 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  50 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  50 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  50 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  49.75 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  50 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.52 
 
 		 621 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.51 
 
 		 423 aa  428  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.63 
 
 		 644 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.12 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  50 
 
 		 406 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.61 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.02 
 
 		 674 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.51 
 
 		 610 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.92 
 
 		 418 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>