More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4070 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4070  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
488 aa  973    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000278055  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5945  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.19 
 
 
492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3897  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.91 
 
 
482 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.88 
 
 
478 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000110203  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1370  NADH dehydrogenase I chain M  48.65 
 
 
487 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.272917  normal  0.783597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1234  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.22 
 
 
483 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.97 
 
 
519 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  40.78 
 
 
522 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.13 
 
 
525 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.78 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.78 
 
 
535 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.82 
 
 
535 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.33 
 
 
497 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
501 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
502 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  39.92 
 
 
502 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  40.12 
 
 
502 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  37.8 
 
 
510 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  39.71 
 
 
512 aa  359  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.45 
 
 
542 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.45 
 
 
542 aa  358  9e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.08 
 
 
507 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  39.38 
 
 
502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.45 
 
 
542 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  37.92 
 
 
489 aa  356  6.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  38.43 
 
 
496 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.2 
 
 
491 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  38.22 
 
 
496 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  38.22 
 
 
496 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  38.22 
 
 
496 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  38.02 
 
 
496 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.49 
 
 
517 aa  353  5.9999999999999994e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
496 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  39.87 
 
 
505 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  38.02 
 
 
496 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  37.73 
 
 
502 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  38.46 
 
 
505 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.34 
 
 
514 aa  349  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  38.07 
 
 
494 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.07 
 
 
494 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  40.19 
 
 
503 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  40.19 
 
 
503 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.7 
 
 
503 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  39.25 
 
 
506 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  39.35 
 
 
502 aa  347  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  38.31 
 
 
502 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  37.5 
 
 
503 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.34 
 
 
495 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  37.91 
 
 
491 aa  343  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2824  NADH-quinone oxidoreductase chain M  38.95 
 
 
501 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2693  NADH-quinone oxidoreductase chain M  38.95 
 
 
501 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  37.58 
 
 
495 aa  342  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0193  NADH dehydrogenase subunit M  38.79 
 
 
507 aa  342  8e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  38 
 
 
505 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1415  NADH dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 
491 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.508375  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.09 
 
 
585 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.93 
 
 
491 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.59 
 
 
516 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  38.12 
 
 
513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39 
 
 
534 aa  339  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  38.76 
 
 
513 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.6 
 
 
501 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.6 
 
 
504 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.27 
 
 
495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  38.55 
 
 
513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  37.55 
 
 
513 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  34.67 
 
 
504 aa  336  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  37.01 
 
 
497 aa  336  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  37.63 
 
 
496 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  37.63 
 
 
496 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  37.68 
 
 
494 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.22 
 
 
491 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.51 
 
 
507 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.74 
 
 
504 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0884  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.23 
 
 
491 aa  333  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  36.22 
 
 
515 aa  333  6e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.73 
 
 
503 aa  332  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  37.32 
 
 
493 aa  332  8e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.61 
 
 
508 aa  332  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.92 
 
 
527 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  38.34 
 
 
494 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.61 
 
 
504 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.71 
 
 
527 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.09 
 
 
527 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  36.09 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.68 
 
 
506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3498  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.02 
 
 
491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1275  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.04 
 
 
491 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512446  normal  0.301879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  37.42 
 
 
521 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.89 
 
 
506 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  36.81 
 
 
494 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.77 
 
 
504 aa  326  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>