More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1370 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1370  NADH dehydrogenase I chain M  100 
 
 
487 aa  954    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.272917  normal  0.783597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3897  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.37 
 
 
482 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4070  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.32 
 
 
488 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000278055  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5945  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.36 
 
 
492 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.11 
 
 
478 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000110203  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1234  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.33 
 
 
483 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.7 
 
 
525 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  38.48 
 
 
522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.85 
 
 
517 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.86 
 
 
519 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.63 
 
 
535 aa  349  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.64 
 
 
535 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.57 
 
 
510 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  36.03 
 
 
501 aa  335  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  37.63 
 
 
504 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.04 
 
 
535 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.85 
 
 
497 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  37.53 
 
 
515 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.91 
 
 
508 aa  333  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  38.02 
 
 
502 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.65 
 
 
585 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  37.18 
 
 
513 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  38.73 
 
 
494 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.77 
 
 
507 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  37.81 
 
 
502 aa  330  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  37.6 
 
 
502 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.99 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.99 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  37.53 
 
 
505 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  37.11 
 
 
505 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  36.63 
 
 
502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.78 
 
 
542 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.15 
 
 
516 aa  325  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.32 
 
 
514 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.8 
 
 
521 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  36.7 
 
 
505 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  39.61 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  37.78 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  37.92 
 
 
503 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  37.09 
 
 
489 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  36.49 
 
 
512 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  37.74 
 
 
502 aa  319  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  37.42 
 
 
513 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  37.07 
 
 
513 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  36.89 
 
 
503 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.68 
 
 
506 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.47 
 
 
506 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  37.22 
 
 
513 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.73 
 
 
503 aa  316  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.84 
 
 
508 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000116263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  36.84 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.37 
 
 
495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0193  NADH dehydrogenase subunit M  37.58 
 
 
507 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  35.34 
 
 
521 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  37.1 
 
 
503 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.07 
 
 
517 aa  312  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.81 
 
 
494 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  37.81 
 
 
494 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.9 
 
 
504 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.65 
 
 
527 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.65 
 
 
527 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.44 
 
 
503 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.2 
 
 
527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.45 
 
 
534 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2047  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.11 
 
 
506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.688388  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.48 
 
 
534 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1668  NADH dehydrogenase subunit M  40.04 
 
 
503 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.95 
 
 
505 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1816  NADH dehydrogenase subunit M  37.17 
 
 
517 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000292544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.66 
 
 
495 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  35.29 
 
 
496 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.09 
 
 
504 aa  299  6e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.8 
 
 
505 aa  299  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  35.61 
 
 
494 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  37.56 
 
 
491 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  35.09 
 
 
496 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain M  37.45 
 
 
509 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.763724  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  35.09 
 
 
496 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.76 
 
 
520 aa  296  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  37.24 
 
 
494 aa  295  9e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  34.69 
 
 
496 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  39.2 
 
 
501 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.01 
 
 
491 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  34.69 
 
 
496 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  34.69 
 
 
496 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  34.69 
 
 
496 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.59 
 
 
501 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2683  NADH dehydrogenase subunit M  36.14 
 
 
521 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  34.69 
 
 
496 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4451  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.1 
 
 
510 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1517  NADH dehydrogenase subunit M  37.01 
 
 
505 aa  291  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.561853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.3 
 
 
493 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>