More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1388 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  93.47 
 
 		 291 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.55 
 
 		 287 aa  315  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  53.08 
 
 		 288 aa  314  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.89 
 
 		 287 aa  308  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  49.48 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  48.11 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  45.7 
 
 		 290 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  45.36 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  45.7 
 
 		 290 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  45.36 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  44.67 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  43.64 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  40.56 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  34.51 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  34.51 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  34.15 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  33.8 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  39.67 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.88 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  25.68 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  27.69 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  28.42 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  39.33 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  22.89 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 614 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  24.73 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  26.78 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  23.08 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  28.49 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  26.46 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  25.73 
 
 		 635 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  23.5 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  23.63 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  28.33 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  22.53 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  22.53 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  24 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  29.03 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 		 451 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  24.37 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  26.02 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  22.58 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  22.58 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  25.81 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  27.32 
 
 		 444 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  26.92 
 
 		 449 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  26.32 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  26.95 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  19.23 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  24.87 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  32.86 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  21.98 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  33.06 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  21.43 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  27.22 
 
 		 442 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  23.29 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  23.53 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  26.46 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  25.14 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  23.68 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  31.4 
 
 		 463 aa  52.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  23.16 
 
 		 339 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  23.16 
 
 		 339 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  23.16 
 
 		 339 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  23.08 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  26.19 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  29.41 
 
 		 197 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  28.57 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  32.85 
 
 		 434 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  25.56 
 
 		 445 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  25.81 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  23.43 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  29.03 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  29.27 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  33.07 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  26.74 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  26.74 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2087  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1866  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1820  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  23.81 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  23.28 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  23.81 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2008  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2042  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 349 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000718459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  21.85 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  23.81 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3299  ribosome-associated GTPase  37.65 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0506498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>