152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0094 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0094  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 36 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  72.22 
 
 		 340 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  71.43 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.44 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.44 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.44 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.44 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.44 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  71.43 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3156  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  65.71 
 
 		 338 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  67.65 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  67.65 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  67.65 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  67.65 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  67.65 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  67.65 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  66.67 
 
 		 298 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8254  transposase  69.7 
 
 		 340 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0843801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  66.67 
 
 		 342 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3769  transposase IS116/IS110/IS902  66.67 
 
 		 342 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.71 
 
 		 341 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.71 
 
 		 341 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1157  transposase IS116/IS110/IS902  66.67 
 
 		 331 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2006  transposase IS116/IS110/IS902  66.67 
 
 		 331 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.443757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3732  transposase IS116/IS110/IS902  66.67 
 
 		 331 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  60 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3394  hypothetical protein  58.33 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.856077 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  63.64 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  64.71 
 
 		 349 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  61.76 
 
 		 338 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 348 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  63.64 
 
 		 348 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.76 
 
 		 340 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4009  hypothetical protein  64.71 
 
 		 349 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1429  hypothetical protein  64.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3829  hypothetical protein  64.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.737294 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  55.56 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0464  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 		 332 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  61.76 
 
 		 342 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  66.67 
 
 		 338 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  61.76 
 
 		 342 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 338 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  61.11 
 
 		 346 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  61.76 
 
 		 345 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  61.76 
 
 		 365 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  61.76 
 
 		 365 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  60.61 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  60.61 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  60.61 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  57.58 
 
 		 340 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.94 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.917263  normal  0.896237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.61 
 
 		 302 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.61 
 
 		 341 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.61 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  60.61 
 
 		 342 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 338 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.55 
 
 		 350 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  60 
 
 		 343 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  60 
 
 		 343 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  63.64 
 
 		 231 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.14 
 
 		 338 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  60.61 
 
 		 342 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  57.14 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  57.14 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  57.14 
 
 		 343 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  55.88 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  66.67 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  52.94 
 
 		 341 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.61 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.61 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3394  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  52.94 
 
 		 341 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  55.88 
 
 		 385 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  58.82 
 
 		 455 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.58 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  55.88 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  57.58 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.58 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.94 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.94 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.58 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>