176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2478 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  91.7 
 
 		 519 aa  1001    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 526 aa  1091    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  54.58 
 
 		 537 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.14 
 
 		 536 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.45 
 
 		 544 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  44.55 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.2 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.6 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.76 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  30.92 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.35 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.04 
 
 		 537 aa  241  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.69 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 512 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.4 
 
 		 516 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.14 
 
 		 564 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.07 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.14 
 
 		 495 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.07 
 
 		 555 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.36 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  27 
 
 		 509 aa  156  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.6 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.19 
 
 		 498 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.69 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.44 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.84 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.92 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.81 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.08 
 
 		 389 aa  62  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.92 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.31 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.65 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.38 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.36 
 
 		 370 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.65 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  36.11 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  38.57 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.33 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.65 
 
 		 398 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  31.4 
 
 		 502 aa  54.7  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  32.67 
 
 		 376 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.46 
 
 		 378 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.87 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  32.11 
 
 		 384 aa  53.9  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  36.99 
 
 		 377 aa  53.9  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.13 
 
 		 367 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  36.71 
 
 		 394 aa  53.9  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.62 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  28.77 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  31.93 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  28.8 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.93 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.87 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  31.93 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.76 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.76 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.98 
 
 		 368 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.76 
 
 		 373 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.76 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.56 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  37.5 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  32.29 
 
 		 364 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  37.5 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.3 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  37.04 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  38.24 
 
 		 386 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.63 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.63 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.39 
 
 		 376 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.81 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.67 
 
 		 375 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.96 
 
 		 393 aa  50.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  31.43 
 
 		 386 aa  50.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  32.61 
 
 		 342 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.07 
 
 		 358 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.7 
 
 		 508 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.91 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.85 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.97 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.74 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.9 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  32.74 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  32.38 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.79 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.34 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.94 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  34.25 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.83 
 
 		 412 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.6 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.83 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.43 
 
 		 373 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.18 
 
 		 394 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.41 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.88 
 
 		 374 aa  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>