257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2623 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  37.18 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  37.96 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2449  hypothetical protein  36.1 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2306  hypothetical protein  36.42 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  33.23 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  31.68 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0834  UspA domain protein  32.59 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.652975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1615  UspA domain protein  32.93 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0566  hypothetical protein  34.28 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  31.35 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  28.53 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1119  hypothetical protein  29.65 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2271  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  31.11 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  30.16 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  29.43 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  35.02 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  28.8 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  27.94 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  29.63 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  29.63 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  29.63 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  27.65 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  29.63 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  29.63 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  29.63 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  29.63 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  27.24 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  29.94 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  29.32 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  28.21 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  30.15 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  28.71 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  28.25 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  29.85 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  29.54 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  28.16 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  27.71 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  25.4 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  29.85 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  29.85 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  29.85 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  27.71 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  27.71 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  27.71 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  27.71 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  27.56 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  29.3 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  27.07 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  28.57 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  27.94 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  26.11 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  27.13 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  30.04 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  24.21 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  31.44 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  28.71 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  25.55 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  26.18 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  32.82 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  32.82 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  25.16 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  26.24 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  27.16 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  25.39 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  25.8 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  27.59 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  23.79 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3550  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  32.57 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  32.57 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  30.1 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3969  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  60.38 
 
 		 53 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  23.51 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  23.62 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  24.51 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  24.05 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  25.76 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  22.85 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.16 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.23 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3443  hypothetical protein  27.36 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  25.49 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3288  universal stress protein  24.19 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.47 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  24.17 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.47 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>