157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1615 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1615  UspA domain protein  100 
 
 		 315 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0834  UspA domain protein  75.56 
 
 		 315 aa  504  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.652975  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2449  hypothetical protein  41.08 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2306  hypothetical protein  40.45 
 
 		 312 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2271  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  36.94 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1119  hypothetical protein  36.71 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0566  hypothetical protein  40.63 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  32.93 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  32.32 
 
 		 318 aa  145  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  31.13 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  37.7 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  27.13 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  29.27 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  29.27 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  35.24 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  29.27 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  29.27 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  29.27 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  30.61 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  28.66 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  27.96 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  28.88 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  28.88 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  28.88 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  28.53 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  28.57 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  28.53 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  29.13 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  28.14 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  29.14 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  28.4 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  28.14 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  28.53 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  29.17 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  29.17 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  29.17 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  29.17 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  29.17 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  28.48 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  28.48 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  28.48 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  28.48 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  31.2 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  28.48 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  28.48 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  28.48 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  28.27 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  28.48 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  28.14 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  28.14 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  28.78 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  28.83 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  25.23 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  32.3 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  25.61 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  29.22 
 
 		 254 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  27.3 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  25.53 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  27.05 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  30.11 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3969  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  60.42 
 
 		 53 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  26.87 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  24.73 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  28.26 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  30.65 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  22.27 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.08 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  27.96 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  25 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  29.51 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  29.78 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  29.51 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  25.48 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0722  hypothetical protein  25.08 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.483462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  26.79 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  28.57 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  28.49 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1915  UspA domain-containing protein  25.96 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  27.32 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  28.34 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1667  universal stress protein family  23.58 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0618  hypothetical protein  23.3 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3029  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  27.22 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2734  hypothetical protein  24.02 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3347  hypothetical protein  25.99 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.03 
 
 		 170 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.03 
 
 		 170 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  22.42 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3296  universal stress protein  21.47 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  22.62 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  24.62 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>