188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3969 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3969  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  100 
 
 		 53 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  62.26 
 
 		 320 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  70.83 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  69.57 
 
 		 318 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  60.78 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  63.46 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  60.38 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1615  UspA domain protein  60.42 
 
 		 315 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  59.57 
 
 		 315 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2449  hypothetical protein  54.72 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2306  hypothetical protein  52.83 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  60.38 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  53.85 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1119  hypothetical protein  56.25 
 
 		 313 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  49.06 
 
 		 311 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0834  UspA domain protein  57.45 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.652975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0566  hypothetical protein  57.45 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  49.06 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2271  UspA domain-containing protein  53.85 
 
 		 313 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  50 
 
 		 310 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  48.08 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  50 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  46 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  43.4 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  47.17 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  47.92 
 
 		 316 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  44.23 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  55.56 
 
 		 326 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  47.92 
 
 		 310 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  41.51 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  42.31 
 
 		 311 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  46.15 
 
 		 320 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  39.62 
 
 		 315 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  39.62 
 
 		 315 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  39.62 
 
 		 315 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  39.62 
 
 		 315 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  39.62 
 
 		 315 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  39.22 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  39.22 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  42.22 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  50 
 
 		 316 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  40.38 
 
 		 316 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  38.46 
 
 		 323 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  38.46 
 
 		 319 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  38.46 
 
 		 316 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  43.48 
 
 		 314 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  43.75 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  47.5 
 
 		 307 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  45.65 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  50 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  48.65 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  44.44 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  44.44 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  41.3 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  54.55 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  43.48 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.56 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  45.45 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  47.37 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  45.45 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  38.78 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  54.76 
 
 		 288 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  43.18 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  43.48 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  43.48 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  38 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  40.43 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  48.72 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  47.73 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2103  hypothetical protein  51.35 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0483069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  41.46 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.13 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  44.74 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  38.3 
 
 		 311 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  43.18 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>