99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0030 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0030  chemotaxis signal transduction protein  100 
 
 
146 aa  287  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  39.78 
 
 
164 aa  50.4  7e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30.3 
 
 
158 aa  50.1  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.31 
 
 
158 aa  50.1  1e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.71 
 
 
178 aa  49.3  2e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.31 
 
 
158 aa  48.9  2e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  39.71 
 
 
169 aa  48.1  4e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  39.06 
 
 
183 aa  47.8  5e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  32.53 
 
 
308 aa  47.4  6e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.19617e-06  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  32.84 
 
 
316 aa  47.4  7e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  32.84 
 
 
316 aa  47.4  7e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  30.22 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  30.22 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  36.36 
 
 
313 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  29.09 
 
 
184 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  32.22 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  32.22 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  31.34 
 
 
331 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  33.33 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  34.38 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  34.02 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  40.38 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.29 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  40 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  35.94 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  20.14 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  40 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2054  CheW protein  35.96 
 
 
429 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.665842  hitchhiker  0.000288851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  36.84 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  40 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.72 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  31.11 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.78 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  36.67 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2293  putative CheW protein  30.37 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164304  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  43.4 
 
 
165 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0723  putative CheW protein  31.71 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  43.4 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  39.22 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  27.41 
 
 
316 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.16178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  43.4 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  41.38 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  27.16 
 
 
165 aa  42.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1325  CheW protein  33.73 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.14 
 
 
312 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  28.77 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  38.18 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  28.47 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  28.21 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  29.37 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  41.07 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  26.47 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  34.62 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  43.14 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  41.67 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  38.46 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  33.78 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  41.67 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  41.82 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  29.79 
 
 
165 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  41.82 
 
 
164 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  33.77 
 
 
140 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  38 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  28.21 
 
 
179 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  39.06 
 
 
163 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  32.43 
 
 
185 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.33 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  32.63 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  44.44 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 
314 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.54 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  42.86 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  38.33 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  39.06 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.41 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  38.46 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  33.87 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  26.47 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  40.38 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  47.73 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.72 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  33.33 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  37.7 
 
 
314 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  37.7 
 
 
314 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  26.67 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  26.67 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  36.21 
 
 
189 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  40 
 
 
779 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  34.48 
 
 
175 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  20.71 
 
 
170 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  33.33 
 
 
178 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>