More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0029 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0029  pyruvate kinase  100 
 
 		 456 aa  907    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1106  pyruvate kinase  67.71 
 
 		 448 aa  625  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.25736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0063  pyruvate kinase  63.96 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0580  pyruvate kinase  34.86 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000249893  decreased coverage  0.00109263 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0330  pyruvate kinase  37.62 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  33.25 
 
 		 577 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  35.41 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  36.84 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  37.08 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  35.44 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  35.35 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  36.12 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  35.02 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  35.49 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  35.87 
 
 		 478 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  35.25 
 
 		 582 aa  210  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1961  pyruvate kinase  35.19 
 
 		 452 aa  209  8e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  35.1 
 
 		 470 aa  209  9e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  36 
 
 		 470 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1561  pyruvate kinase  33.89 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  36.12 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  33.92 
 
 		 487 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  36.04 
 
 		 497 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1412  pyruvate kinase  34.91 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000231842  hitchhiker  0.00097059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  31.06 
 
 		 474 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  33.25 
 
 		 583 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  32.87 
 
 		 476 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  34.08 
 
 		 495 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  34.56 
 
 		 477 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  34.77 
 
 		 484 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  32.31 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  33.4 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  35.65 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  35.65 
 
 		 483 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  34.56 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  32.55 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  35.25 
 
 		 475 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  31.31 
 
 		 583 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  34.37 
 
 		 586 aa  202  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  33.89 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  34.45 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  35.58 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  35.97 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  32.86 
 
 		 590 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  32.78 
 
 		 585 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  35.1 
 
 		 479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  34.69 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  34.86 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  33.41 
 
 		 494 aa  199  7e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  32.77 
 
 		 580 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  34.48 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  35.89 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  33.33 
 
 		 601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  32.94 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  33.1 
 
 		 592 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  32.87 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  33.1 
 
 		 592 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  34.29 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  35.01 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  34.29 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  35.01 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  34.52 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  31.49 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  33.66 
 
 		 481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  31.19 
 
 		 578 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  34.77 
 
 		 471 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  35.7 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  34.29 
 
 		 484 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  31.25 
 
 		 485 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  34.83 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  35.01 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  36.41 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  32.08 
 
 		 585 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  35.73 
 
 		 478 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  35.73 
 
 		 478 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  32.56 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  34.03 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  31.21 
 
 		 583 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  34.68 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  31.83 
 
 		 582 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  31.31 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2244  pyruvate kinase  32.65 
 
 		 480 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0168966 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  33.65 
 
 		 490 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  34.79 
 
 		 475 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  35.32 
 
 		 479 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  31.9 
 
 		 466 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  34.75 
 
 		 479 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  33.18 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  32.53 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  31.68 
 
 		 584 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  33.33 
 
 		 472 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  35.52 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  33.02 
 
 		 600 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0740  pyruvate kinase  31.67 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  30.8 
 
 		 585 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  34.44 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  30.48 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  32.62 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  34.76 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  34.38 
 
 		 473 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>