More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1106 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1106  pyruvate kinase  100 
 
 
448 aa  899    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.25736  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0063  pyruvate kinase  68.97 
 
 
449 aa  633  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0029  pyruvate kinase  67.71 
 
 
456 aa  625  1e-178  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0580  pyruvate kinase  36.34 
 
 
456 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000249893  decreased coverage  0.00109263 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0330  pyruvate kinase  37.32 
 
 
464 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  34.35 
 
 
577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  34.99 
 
 
583 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  34.11 
 
 
477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  33.69 
 
 
477 aa  219  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  33.03 
 
 
585 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  34.04 
 
 
578 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  33.55 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  31.84 
 
 
476 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  34.22 
 
 
471 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1961  pyruvate kinase  35.66 
 
 
452 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0740  pyruvate kinase  32.9 
 
 
466 aa  209  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  33.89 
 
 
472 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  33.64 
 
 
475 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1103  pyruvate kinase  32.3 
 
 
472 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  33.17 
 
 
497 aa  203  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  32.29 
 
 
478 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  33.56 
 
 
472 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  32.33 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  32.78 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0544  pyruvate kinase  32.86 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  31.98 
 
 
583 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  32.33 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  32.55 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  32.38 
 
 
594 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  33.33 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  33.64 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  34.11 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5259  pyruvate kinase  33.25 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  33.33 
 
 
467 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  33.57 
 
 
481 aa  200  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  31.37 
 
 
474 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  30.96 
 
 
582 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  34.33 
 
 
470 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  31.09 
 
 
478 aa  199  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  32.17 
 
 
585 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0965  pyruvate kinase  33.02 
 
 
470 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0242596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  33.49 
 
 
471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  31.42 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0432  pyruvate kinase  34.7 
 
 
484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  33.41 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  30.8 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  33.17 
 
 
477 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  33.25 
 
 
481 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  32.77 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  32.77 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  34.03 
 
 
484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1412  pyruvate kinase  35.94 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000231842  hitchhiker  0.00097059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  32.77 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  33.1 
 
 
487 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  33.09 
 
 
473 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  32.06 
 
 
478 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  34.47 
 
 
475 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  30.09 
 
 
580 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  32.77 
 
 
471 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  33.8 
 
 
585 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  34.41 
 
 
484 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  31.75 
 
 
494 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1032  pyruvate kinase  31.37 
 
 
470 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  33.49 
 
 
478 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3121  pyruvate kinase  33.09 
 
 
485 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  30.02 
 
 
470 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  32.53 
 
 
470 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  34.41 
 
 
484 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  34.13 
 
 
490 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  33.25 
 
 
586 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  34.19 
 
 
484 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  32.44 
 
 
478 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  32.77 
 
 
476 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  32.86 
 
 
488 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1561  pyruvate kinase  30.77 
 
 
478 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  31.4 
 
 
478 aa  193  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  33.57 
 
 
478 aa  192  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  32.46 
 
 
479 aa  193  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  33.57 
 
 
478 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  32.94 
 
 
478 aa  193  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  31.95 
 
 
480 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  30.91 
 
 
589 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2125  pyruvate kinase  31.92 
 
 
478 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  31.33 
 
 
475 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  32.46 
 
 
472 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  32.12 
 
 
484 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  30.39 
 
 
584 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  29.06 
 
 
474 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  31.67 
 
 
592 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  32.19 
 
 
518 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  31.67 
 
 
592 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0731  pyruvate kinase  32.54 
 
 
469 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0570587  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  30.62 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  32.85 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  31.69 
 
 
471 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  30.79 
 
 
601 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0228  pyruvate kinase  32.37 
 
 
482 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  31.72 
 
 
492 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2605  pyruvate kinase  32.71 
 
 
588 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  30.26 
 
 
590 aa  189  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>