More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3877 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  587  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  47.16 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.64 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.99 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  43.77 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  45.42 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  43.06 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  41.99 
 
 		 335 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  41.36 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.67 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  39.06 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  39.16 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  39.64 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.49 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  40.33 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  40.71 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.71 
 
 		 312 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  38.71 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  40.4 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  39.35 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  40.35 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  39.03 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  38.74 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  39.03 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  42.27 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  38.71 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  38.71 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  38.71 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  39.2 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  39.2 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  38.71 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  38.87 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  37.15 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  42.32 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  38.36 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  38.21 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  37.71 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  38.83 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  35.52 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  35.05 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  33.99 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  31.35 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  37.37 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.17 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  35.96 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  35.96 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  35.98 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  36.08 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  34.33 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  32.09 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  36.96 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  33.92 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  33.33 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.87 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  33.94 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  30.72 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  31.46 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.9 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  36.33 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.47 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  33.68 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  31.03 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.91 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.21 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  32.69 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  31.5 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  32.85 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  30.64 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  26.8 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  30.95 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.39 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  32.35 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  27.24 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  26.5 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  30.39 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  27.92 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.12 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2400  hypothetical protein  27.89 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  30.42 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  30.16 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.15 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>