203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04642 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  65.23 
 
 		 826 aa  1100    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  67.5 
 
 		 792 aa  1127    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 813 aa  1664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  68.12 
 
 		 792 aa  1136    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  36.29 
 
 		 738 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  35.36 
 
 		 753 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  33.68 
 
 		 926 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  33.25 
 
 		 937 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  34.59 
 
 		 922 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  35.64 
 
 		 924 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  33.2 
 
 		 905 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  32.6 
 
 		 934 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  32.64 
 
 		 935 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 757 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  31.78 
 
 		 932 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  32.59 
 
 		 821 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  33.51 
 
 		 728 aa  372  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  32.97 
 
 		 836 aa  364  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 751 aa  360  9e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  32.94 
 
 		 919 aa  357  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  31.96 
 
 		 938 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  31.84 
 
 		 794 aa  351  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  31.83 
 
 		 791 aa  345  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  32.35 
 
 		 820 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  32.17 
 
 		 783 aa  340  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  30.6 
 
 		 929 aa  340  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  31.74 
 
 		 778 aa  337  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  32.43 
 
 		 803 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  30.3 
 
 		 1091 aa  337  7.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  32.03 
 
 		 822 aa  333  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  29.25 
 
 		 788 aa  326  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  29.86 
 
 		 786 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  30.08 
 
 		 773 aa  325  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  27.98 
 
 		 788 aa  324  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  30.86 
 
 		 750 aa  323  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  29.2 
 
 		 764 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  33.18 
 
 		 849 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  30.07 
 
 		 735 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  31.34 
 
 		 814 aa  320  9e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.34 
 
 		 789 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  30.04 
 
 		 781 aa  319  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  29.62 
 
 		 786 aa  320  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  29.74 
 
 		 786 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  29.74 
 
 		 786 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  29.74 
 
 		 786 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  29.49 
 
 		 786 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  29.78 
 
 		 786 aa  317  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  30.2 
 
 		 766 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  29.28 
 
 		 790 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  29.6 
 
 		 774 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  29.4 
 
 		 771 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  31.22 
 
 		 780 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  31.22 
 
 		 750 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  28.04 
 
 		 765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  28.04 
 
 		 765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  29.51 
 
 		 787 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  31.27 
 
 		 839 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  31.22 
 
 		 750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.84 
 
 		 765 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  28.66 
 
 		 774 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  31.14 
 
 		 839 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  27.68 
 
 		 765 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  30.12 
 
 		 811 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  29.18 
 
 		 813 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  28.03 
 
 		 773 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  30.22 
 
 		 856 aa  303  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  28.87 
 
 		 813 aa  303  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  28.44 
 
 		 810 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  30.24 
 
 		 860 aa  301  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  28.06 
 
 		 765 aa  300  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  30.17 
 
 		 784 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  29.38 
 
 		 774 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  29.06 
 
 		 787 aa  298  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  29.06 
 
 		 787 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 787 aa  298  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 787 aa  298  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 787 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  29.06 
 
 		 787 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  28.64 
 
 		 799 aa  297  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  29.17 
 
 		 761 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  28.73 
 
 		 787 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 765 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  29.31 
 
 		 786 aa  295  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 765 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  29.31 
 
 		 786 aa  295  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  28.63 
 
 		 765 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  29.31 
 
 		 786 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  29.31 
 
 		 786 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.15 
 
 		 765 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0104  organic solvent tolerance protein  29.29 
 
 		 784 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  28.1 
 
 		 824 aa  293  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  29.71 
 
 		 781 aa  292  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  29.55 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  29.55 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  28.59 
 
 		 799 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 784 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>