More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1559 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  100 
 
 		 461 aa  939    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  82.65 
 
 		 461 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  97.4 
 
 		 461 aa  922    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  97.18 
 
 		 461 aa  919    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  56.58 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  59.65 
 
 		 466 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  54.53 
 
 		 465 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 513 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  51.34 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  50.54 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  50.44 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  51.84 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  51.87 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 461 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50 
 
 		 471 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  51.97 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  49.66 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  49.57 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  47.94 
 
 		 466 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_002620  TC0244  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  48.88 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  48.88 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  49.57 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  50.55 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 478 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 631 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  48.55 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  46.71 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  47.87 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  51 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  48.21 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  48.68 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  48.9 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  49.67 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  46.71 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  48.1 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  48.9 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  46.64 
 
 		 464 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  47.87 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  48.1 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 470 aa  450  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  47.29 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  46.96 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  48.68 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  47.29 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  47.29 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  46.49 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  48.91 
 
 		 467 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  47.87 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  47.87 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  47.29 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  48.55 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  46.19 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  46.85 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  46.41 
 
 		 469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  50.45 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  47.32 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>