More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68683 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  61.19 
 
 		 751 aa  923    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  100 
 
 		 752 aa  1553    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  47.77 
 
 		 732 aa  673    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  44.8 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  42.16 
 
 		 631 aa  422  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  41.49 
 
 		 521 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  40.88 
 
 		 623 aa  401  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  38.53 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  38.84 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  39.11 
 
 		 610 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  38.7 
 
 		 685 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  37.52 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  38.24 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  38.42 
 
 		 642 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  39.15 
 
 		 645 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  40.83 
 
 		 582 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  38.19 
 
 		 615 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  37.61 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  36.99 
 
 		 645 aa  365  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  37.82 
 
 		 625 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  39.66 
 
 		 524 aa  362  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  34.73 
 
 		 627 aa  360  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 		 636 aa  360  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  36.8 
 
 		 625 aa  359  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 		 532 aa  357  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  37.45 
 
 		 615 aa  357  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  36.31 
 
 		 618 aa  357  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  37 
 
 		 637 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  37 
 
 		 637 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 		 532 aa  355  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  37 
 
 		 637 aa  355  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  36.87 
 
 		 636 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  36.23 
 
 		 629 aa  353  8.999999999999999e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  36.78 
 
 		 637 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  37.5 
 
 		 619 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  36.53 
 
 		 625 aa  351  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 637 aa  350  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 627 aa  350  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  35.66 
 
 		 664 aa  350  6e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  35.67 
 
 		 625 aa  349  9e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 		 640 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  35.8 
 
 		 637 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  36.72 
 
 		 656 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  35.8 
 
 		 637 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 635 aa  348  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  35.8 
 
 		 637 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  37.32 
 
 		 625 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  35.61 
 
 		 636 aa  348  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 635 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1232  ABC transporter related  35.99 
 
 		 626 aa  348  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.072507  normal  0.215663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 635 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 635 aa  348  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 635 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  37.36 
 
 		 626 aa  347  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  35.62 
 
 		 637 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  35.52 
 
 		 625 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 637 aa  345  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  35.44 
 
 		 627 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  35.25 
 
 		 627 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  36.21 
 
 		 657 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.83 
 
 		 637 aa  344  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 637 aa  344  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 637 aa  344  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 637 aa  344  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 637 aa  344  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  35.83 
 
 		 637 aa  344  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 637 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  37.04 
 
 		 622 aa  344  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 		 635 aa  343  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.66 
 
 		 635 aa  342  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.66 
 
 		 635 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  36.3 
 
 		 636 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  35.5 
 
 		 628 aa  340  4e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  36.04 
 
 		 627 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  35.66 
 
 		 633 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 		 637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 		 630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 637 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 634 aa  337  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  34.56 
 
 		 663 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  36 
 
 		 634 aa  336  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 		 638 aa  336  9e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  34.38 
 
 		 672 aa  335  2e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  35.09 
 
 		 631 aa  335  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  34 
 
 		 627 aa  335  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.88 
 
 		 639 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 624 aa  333  8e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  34.69 
 
 		 650 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  36.13 
 
 		 625 aa  332  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  36.79 
 
 		 636 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  35.13 
 
 		 657 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  36.2 
 
 		 638 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  35.05 
 
 		 625 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  35.14 
 
 		 621 aa  330  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  36.43 
 
 		 633 aa  330  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  36.65 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>