104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10251 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10251  predicted protein  100 
 
 		 306 aa  637    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0349969  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36409  predicted protein  50.87 
 
 		 471 aa  296  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.306312  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31704  mitochondrial RNA helicase  50 
 
 		 640 aa  286  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00121417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06190  RNA helicase like protein, putative  48.84 
 
 		 828 aa  271  9e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04723  mitochondrial ATP-dependent RNA helicase Suv3, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10820)  48.84 
 
 		 832 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0229389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2359  helicase domain-containing protein  45.61 
 
 		 585 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2066  helicase domain-containing protein  44.93 
 
 		 585 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0938  helicase domain-containing protein  43.66 
 
 		 789 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0436  helicase domain protein  43.88 
 
 		 815 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0710  helicase domain protein  44.96 
 
 		 778 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0811  helicase domain-containing protein  43.53 
 
 		 714 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4414  helicase domain-containing protein  42.25 
 
 		 714 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0754  helicase domain protein  43.17 
 
 		 714 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1967  helicase-like  43.77 
 
 		 932 aa  208  8e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2996  helicase domain-containing protein  42.45 
 
 		 757 aa  205  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2739  helicase-like protein  36.56 
 
 		 920 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3311  helicase-like  35.02 
 
 		 978 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505804  normal  0.0528841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7546  putative ATP-dependent RNA and DNA helicase  34.66 
 
 		 1177 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5700  helicase domain protein  31.77 
 
 		 793 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.660496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0545  helicase-like  34.3 
 
 		 1169 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0074  helicase-like  33.57 
 
 		 1066 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1705  photosynthesis protein modulator  34.6 
 
 		 1003 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000107497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4118  helicase domain-containing protein  33.94 
 
 		 851 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0121  helicase-like  34.77 
 
 		 855 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1698  helicase domain-containing protein  33.68 
 
 		 997 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3088  helicase domain-containing protein  34.2 
 
 		 837 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3248  helicase domain protein  35.48 
 
 		 1139 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.916633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0409  helicase  35.74 
 
 		 1124 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1131  helicase domain-containing protein  34.11 
 
 		 1027 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.322366  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0253  helicase domain protein  33.83 
 
 		 890 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0783  helicase domain protein  34.17 
 
 		 987 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000205991  normal  0.0820229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2292  helicase domain-containing protein  33.69 
 
 		 925 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.94626  normal  0.593111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3540  helicase domain-containing protein  31.68 
 
 		 865 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420075  normal  0.672772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0492  helicase domain protein  33.21 
 
 		 1093 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0504  helicase-like  33.57 
 
 		 1140 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.68867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0074  helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 1142 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313294  normal  0.416773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4904  helicase domain protein  33.22 
 
 		 1138 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.891527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0573  helicase-like  33.92 
 
 		 984 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.013088  hitchhiker  0.00000121316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2285  helicase domain protein  33.45 
 
 		 550 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0548  helicase  35.02 
 
 		 1145 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0281  helicase-like  35.02 
 
 		 1119 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.288418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3376  helicase-like  34.2 
 
 		 1037 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4394  helicase domain-containing protein  32.87 
 
 		 1140 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4857  helicase domain protein  32.87 
 
 		 1136 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526105  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1828  helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 975 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232638  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4347  ATP-dependent helicase  32.75 
 
 		 1047 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2639  helicase domain-containing protein  32.49 
 
 		 1101 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1721  helicase domain protein  31.91 
 
 		 1135 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3115  helicase domain-containing protein  32.97 
 
 		 1026 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4802  helicase domain-containing protein  32.62 
 
 		 1154 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.782354  decreased coverage  0.000173761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3817  helicase domain protein  32.87 
 
 		 1087 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4146  helicase domain protein  32.74 
 
 		 1082 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139556  normal  0.136367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2422  putative ATP-dependent helicase, MgpS  32.94 
 
 		 930 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3705  helicase domain-containing protein  31.13 
 
 		 1081 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.402139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4122  hypothetical protein  39.81 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0288564  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1086  helicase domain-containing protein  44.71 
 
 		 786 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  28.65 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  46 
 
 		 872 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.66 
 
 		 861 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.66 
 
 		 861 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  46 
 
 		 1293 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  22.49 
 
 		 861 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 		 868 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  46 
 
 		 1239 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  46.94 
 
 		 1023 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  40 
 
 		 1185 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38 
 
 		 952 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  40 
 
 		 877 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.73 
 
 		 838 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 832 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  36.73 
 
 		 885 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  24.03 
 
 		 885 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.73 
 
 		 835 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0090  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.84 
 
 		 984 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000165147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  36.73 
 
 		 830 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.73 
 
 		 852 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 852 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 851 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  27.48 
 
 		 712 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 852 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 		 876 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.96 
 
 		 662 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.73 
 
 		 837 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.05 
 
 		 825 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  38 
 
 		 1068 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 837 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.78 
 
 		 832 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.73 
 
 		 827 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.73 
 
 		 710 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.73 
 
 		 847 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  40 
 
 		 933 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 950 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  38 
 
 		 863 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.19 
 
 		 861 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.24 
 
 		 817 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  30.77 
 
 		 726 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  36.73 
 
 		 891 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 		 709 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 836 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  38 
 
 		 1073 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>