More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38509 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  100 
 
 
301 aa  616  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  43.29 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  43.73 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  45.38 
 
 
324 aa  219  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  40.53 
 
 
300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  40.53 
 
 
306 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  40.07 
 
 
298 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  39.4 
 
 
299 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  36.88 
 
 
302 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  36.88 
 
 
302 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  41.53 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  39.4 
 
 
321 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  37.95 
 
 
303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  40.33 
 
 
315 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  39.53 
 
 
302 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  39.04 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  38.44 
 
 
298 aa  188  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  36.93 
 
 
297 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  41.56 
 
 
306 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  41.58 
 
 
319 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  37.29 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  37.05 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  39.8 
 
 
321 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.18 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  38.56 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.18 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.24 
 
 
297 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.24 
 
 
297 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  38.49 
 
 
310 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.18 
 
 
297 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  39.07 
 
 
307 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  37.82 
 
 
297 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  37.82 
 
 
297 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  37.82 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  39.06 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  37.82 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  38.13 
 
 
326 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  37.82 
 
 
297 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  40.47 
 
 
311 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  40.33 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  38.44 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  39.46 
 
 
307 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  37.09 
 
 
306 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  36.3 
 
 
301 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  37.2 
 
 
299 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  36.88 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  38.05 
 
 
311 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  36.36 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  39.06 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  37.37 
 
 
309 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  38.05 
 
 
308 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  38.05 
 
 
308 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  36.42 
 
 
306 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  38.18 
 
 
282 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  34.93 
 
 
308 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  37.12 
 
 
328 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  35.69 
 
 
305 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  36.79 
 
 
327 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  35.79 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  35.57 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  35.2 
 
 
324 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  36.33 
 
 
341 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  35.31 
 
 
307 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  37.16 
 
 
322 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  36.59 
 
 
318 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  35.86 
 
 
310 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  34.78 
 
 
328 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  39.6 
 
 
351 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  33.66 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  35.02 
 
 
304 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  35.53 
 
 
302 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  34.32 
 
 
306 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  33.44 
 
 
306 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  35.45 
 
 
309 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  32.45 
 
 
306 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  34.34 
 
 
309 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  32.24 
 
 
309 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  34.88 
 
 
308 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  33.56 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  35.31 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  35.76 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.04 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.02 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  36.07 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  34.54 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  32.32 
 
 
309 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.98 
 
 
319 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.26 
 
 
315 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.31 
 
 
309 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.99 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  30.22 
 
 
314 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.57 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  34.93 
 
 
306 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  34.62 
 
 
301 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  27.65 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.13 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.82 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  26.09 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  26.09 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.09 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>