More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22332 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_22332  predicted protein  100 
 
 		 579 aa  1192    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0126456  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22325  predicted protein  99.31 
 
 		 579 aa  1184    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  34.01 
 
 		 646 aa  280  3e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  36.19 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  29.06 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  31.62 
 
 		 594 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  29.1 
 
 		 614 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  29.75 
 
 		 634 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.01 
 
 		 616 aa  226  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 623 aa  226  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.84 
 
 		 632 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.48 
 
 		 782 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.1 
 
 		 641 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  30.02 
 
 		 619 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.63 
 
 		 586 aa  220  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.62 
 
 		 627 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  29.49 
 
 		 597 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.2 
 
 		 639 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.12 
 
 		 616 aa  210  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 629 aa  210  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.73 
 
 		 608 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.04 
 
 		 608 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.58 
 
 		 592 aa  207  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.1 
 
 		 589 aa  206  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  29.42 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.75 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.83 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  29.06 
 
 		 581 aa  204  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  32.83 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.18 
 
 		 580 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.18 
 
 		 590 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.32 
 
 		 600 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.58 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  30.19 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  29.47 
 
 		 585 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.37 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.45 
 
 		 598 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  28.36 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.73 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0078  ABC transporter related  28.8 
 
 		 643 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.503479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.73 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.65 
 
 		 619 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.62 
 
 		 600 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  29.84 
 
 		 650 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.15 
 
 		 583 aa  197  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  29.38 
 
 		 597 aa  197  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  28.6 
 
 		 600 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  29.03 
 
 		 594 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  28.75 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.62 
 
 		 625 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  29.6 
 
 		 598 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.43 
 
 		 579 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  31.26 
 
 		 600 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76772  ATP-binding cassette transporter family member  29.52 
 
 		 575 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.36 
 
 		 597 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.74 
 
 		 605 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.7 
 
 		 597 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.04 
 
 		 583 aa  193  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  29.07 
 
 		 600 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.52 
 
 		 605 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  29.03 
 
 		 645 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.12 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.37 
 
 		 582 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0646  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.98 
 
 		 592 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.27 
 
 		 603 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  29.29 
 
 		 606 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.91 
 
 		 600 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.9 
 
 		 579 aa  190  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  27.76 
 
 		 603 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.35 
 
 		 628 aa  189  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  28.26 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.02 
 
 		 582 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.17 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  26.95 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.39 
 
 		 595 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.09 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.4 
 
 		 578 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  28.76 
 
 		 649 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  30.31 
 
 		 681 aa  189  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  28.63 
 
 		 588 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  25.78 
 
 		 760 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  28.2 
 
 		 632 aa  187  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  27.44 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  30.12 
 
 		 599 aa  186  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  27.29 
 
 		 566 aa  186  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.44 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.44 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.22 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04730  ATP-binding cassette, sub-family b, member 10, mitochondrial precursor, putative  30.05 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.59161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.38 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0313  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.5 
 
 		 580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.532143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  28.36 
 
 		 634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01820  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  30.83 
 
 		 725 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.79 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  25.99 
 
 		 764 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  27.78 
 
 		 634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  26.13 
 
 		 647 aa  185  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.87 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.43 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.49 
 
 		 582 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>