50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1471 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  37.27 
 
 		 165 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  35.85 
 
 		 172 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  33.78 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  33.77 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  32.34 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  40.54 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  32.5 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  31.87 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  31.87 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  31.33 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  31.21 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  31.33 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  27.38 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  29.66 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  29.66 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  27.85 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.5 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  26.32 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  27.53 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  32.29 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  25.97 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  23.78 
 
 		 229 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  25.62 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  28.3 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  24 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  26.21 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  22.88 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  24.16 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  22.88 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  22.88 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.88 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  25.61 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  24.84 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  23.68 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  33.78 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  29.7 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  29.21 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  31.4 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  23.53 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  24.26 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  28.41 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  32 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  28.67 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 		 243 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  28.38 
 
 		 161 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  28.33 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  22.06 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  24.63 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>