More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01871 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  83.47 
 
 		 242 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  83.06 
 
 		 242 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  78.86 
 
 		 245 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  77.24 
 
 		 245 aa  384  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  82.91 
 
 		 233 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  75.1 
 
 		 242 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  75.1 
 
 		 242 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  73.86 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  73.44 
 
 		 242 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 235 aa  284  9e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.39 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 231 aa  262  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.98 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.98 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.17 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  36.75 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.68 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  38.36 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  36.84 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  36.84 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  36.61 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.79 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.77 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  37.09 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  39.31 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  38.62 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  43.83 
 
 		 403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  41.48 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.22 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  39.31 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.43 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  39.31 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  39.31 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.88 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  38.62 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  44.72 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  38.62 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.34 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.18 
 
 		 354 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  43.9 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.67 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.2 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  40.41 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.2 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  43.9 
 
 		 258 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  32.29 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  34.1 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  47.06 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.74 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.31 
 
 		 1426 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  31.84 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.13 
 
 		 1131 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.76 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.96 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.76 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.76 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  32.55 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  34.83 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  34.83 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  34.83 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  34.83 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>