268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1480 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  546  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.18 
 
 
262 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  32.73 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  36.28 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  36.07 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  29.2 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  36.07 
 
 
260 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  33.63 
 
 
241 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  34.53 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  31.84 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  34.47 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  34.3 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  35.87 
 
 
265 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  34.47 
 
 
278 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  33.81 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  37.07 
 
 
243 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  33.82 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  30.43 
 
 
252 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  31.39 
 
 
230 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  29.47 
 
 
243 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  33.62 
 
 
240 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  47.17 
 
 
266 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  34.58 
 
 
247 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  30.09 
 
 
253 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  26.87 
 
 
223 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  29.36 
 
 
243 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  24.9 
 
 
244 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28 
 
 
227 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  26.07 
 
 
224 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  31.11 
 
 
251 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  40.8 
 
 
221 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.29 
 
 
252 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  30.09 
 
 
255 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  29.2 
 
 
253 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28 
 
 
227 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  32 
 
 
233 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  31.39 
 
 
228 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  33 
 
 
198 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  31.11 
 
 
254 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  30.84 
 
 
237 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  30.94 
 
 
228 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  29.78 
 
 
249 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  44.55 
 
 
241 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  33.94 
 
 
239 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  30.7 
 
 
261 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  29.33 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  28.76 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  31.14 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.48 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.81 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  31.86 
 
 
240 aa  95.5  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  45.92 
 
 
236 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  35.58 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1260  hypothetical protein  32.34 
 
 
256 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.017504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.54 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  33.19 
 
 
228 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  35.96 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.18 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  51.28 
 
 
300 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  51.28 
 
 
300 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  38.79 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.52 
 
 
237 aa  92  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  49.33 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  52.56 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  23.48 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  25.78 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  52.05 
 
 
301 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  31.42 
 
 
227 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  46.67 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  42.55 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  28.23 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  52.05 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  32.08 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  33.95 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  50.68 
 
 
295 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  32.88 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  52.05 
 
 
292 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  50.68 
 
 
292 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  50.68 
 
 
316 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  50.68 
 
 
285 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  50.68 
 
 
295 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  52.05 
 
 
292 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  50.68 
 
 
303 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  50.68 
 
 
295 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.32 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  52.05 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  23.96 
 
 
235 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  29.63 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  30.95 
 
 
227 aa  85.9  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  46.84 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>