More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0961 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  100 
 
 		 404 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  48.75 
 
 		 403 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  48.04 
 
 		 479 aa  336  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  48.75 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  48.75 
 
 		 403 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  50 
 
 		 468 aa  330  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  47.37 
 
 		 403 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.03 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  42.25 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  43 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  44.22 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  44.55 
 
 		 412 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  43.65 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  44.11 
 
 		 413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  38.35 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  44 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  44 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  40.65 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  41.25 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.04 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  41.71 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.34 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.95 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.54 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.6 
 
 		 400 aa  273  6e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  44.9 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  43.64 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  43.11 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.43 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.66 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  44.21 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.93 
 
 		 403 aa  262  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  38.75 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  42.39 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  35.68 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  43 
 
 		 399 aa  259  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  43 
 
 		 399 aa  259  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  41.54 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  41.94 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  36.62 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  41.67 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  43.11 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  41.85 
 
 		 421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  42.39 
 
 		 410 aa  252  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  35.93 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  42.39 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  40.5 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.25 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  40.92 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  41.29 
 
 		 416 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  38.71 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  38.23 
 
 		 402 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  43.47 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  43 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  33.5 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  40.83 
 
 		 418 aa  243  6e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.41 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  42.64 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  33.75 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  36.83 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  42.9 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  41.41 
 
 		 422 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  43.97 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  41.38 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  35.62 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  38.5 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  38.69 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.21 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  42.09 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  42.82 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  37.34 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  37.19 
 
 		 537 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  40.9 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  40.75 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  42.57 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  37.56 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  43.47 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  41.4 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  37.97 
 
 		 412 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  38.61 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  40.37 
 
 		 346 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  40.37 
 
 		 346 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  40.36 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  39.2 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  38.44 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>