More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1117 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  91.11 
 
 
371 aa  689  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
371 aa  745  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  8.9327e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  91.11 
 
 
371 aa  689  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  77.09 
 
 
373 aa  605  1e-172  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  76.55 
 
 
374 aa  577  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  72.7 
 
 
372 aa  573  1e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  73.05 
 
 
371 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  71.43 
 
 
371 aa  563  1e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  70.89 
 
 
371 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  2.05251e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  58.79 
 
 
372 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  58.15 
 
 
375 aa  441  1e-122  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  57.99 
 
 
388 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  54.99 
 
 
372 aa  407  1e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  54.89 
 
 
373 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  54.96 
 
 
377 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  57.06 
 
 
368 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  52.28 
 
 
413 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
371 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  52.15 
 
 
366 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  50.28 
 
 
372 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  49.19 
 
 
370 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  48.61 
 
 
373 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  48.61 
 
 
371 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  47.84 
 
 
371 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  52.57 
 
 
378 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64326e-10 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  52.01 
 
 
374 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  52.57 
 
 
378 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
368 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  52.3 
 
 
378 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19526e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  52.3 
 
 
378 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  47.66 
 
 
368 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0552  extracellular ligand-binding receptor  52.45 
 
 
377 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0988947  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  48.63 
 
 
373 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  50.27 
 
 
370 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  49.44 
 
 
371 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.54 
 
 
380 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  46.69 
 
 
368 aa  343  3e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  47.31 
 
 
372 aa  343  3e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  46.41 
 
 
368 aa  338  9e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  45.86 
 
 
368 aa  336  3e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  49.46 
 
 
378 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0569  Extracellular ligand-binding receptor  47.83 
 
 
364 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4698  extracellular ligand-binding receptor  44.88 
 
 
366 aa  329  5e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.026016  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3114  Extracellular ligand-binding receptor  47.2 
 
 
364 aa  329  5e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  46.01 
 
 
374 aa  328  1e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  47.97 
 
 
417 aa  320  2e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  48.08 
 
 
368 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  46.88 
 
 
367 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  45.74 
 
 
367 aa  302  5e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2171  extracellular ligand-binding receptor  45.86 
 
 
370 aa  298  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  44.32 
 
 
375 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  44.17 
 
 
373 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  44.26 
 
 
371 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  43.06 
 
 
373 aa  289  5e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  44.25 
 
 
373 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.4 
 
 
374 aa  283  4e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  44.82 
 
 
375 aa  282  8e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.53 
 
 
399 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  44.85 
 
 
374 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 
372 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  43.53 
 
 
372 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  43.73 
 
 
371 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  43.45 
 
 
371 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  44.01 
 
 
371 aa  273  2e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1935  Extracellular ligand-binding receptor  39.89 
 
 
375 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  42.65 
 
 
371 aa  273  4e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  43.27 
 
 
358 aa  273  5e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  43.79 
 
 
373 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  41.53 
 
 
370 aa  272  8e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  41.47 
 
 
371 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  41.47 
 
 
371 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  41.47 
 
 
371 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  43.45 
 
 
371 aa  269  6e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  41.4 
 
 
373 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3864  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  41.46 
 
 
369 aa  262  7e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3656  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  41.46 
 
 
369 aa  262  7e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3937  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  41.46 
 
 
369 aa  262  7e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0257  Extracellular ligand-binding receptor  41.46 
 
 
369 aa  262  7e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0258  extracellular ligand-binding receptor  41.46 
 
 
369 aa  262  7e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4775  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  41.46 
 
 
369 aa  262  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 
362 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03260  hypothetical protein  41.19 
 
 
369 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03307  leucine transporter subunit  41.19 
 
 
369 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  41.96 
 
 
366 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3668  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  40.16 
 
 
371 aa  259  5e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210463  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0244  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein  40 
 
 
371 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3740  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  41.19 
 
 
369 aa  259  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3974  extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 
371 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0228  extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 
371 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3861  extracellular ligand-binding receptor  39.84 
 
 
369 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3876  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  40.71 
 
 
369 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3755  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  40.71 
 
 
369 aa  253  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3833  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  40.71 
 
 
369 aa  253  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3935  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  40.71 
 
 
369 aa  253  4e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3938  leucine-specific-binding protein  42.22 
 
 
367 aa  253  5e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  40.82 
 
 
373 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>