More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1211 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  43.98 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  34.8 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.72 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.78 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.77 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.77 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.77 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  23.83 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.77 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.41 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 232 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 195 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 195 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.42 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  24.58 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 195 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  25.76 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.32 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  24.58 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  22.51 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  26.39 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.38 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  25.97 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  24.44 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.68 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  24.78 
 
 		 260 aa  85.1  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  25.54 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>